Vilniaus memorialinių muziejų direkcija įkurta 2005 metais. Venclovų namų-muziejaus savininkas yra Vilniaus miesto savivaldybė. Nuo 2005 metų Venclovų namai-muziejus buvo sujungtas su kitais trejais muziejais ir taip buvo įkurta Vilniaus memorialinių muziejų direkcija.