KGB veiklos tyrimo komisija Seimo įkurta 1991 metais. Ji susidaro iš parlamento narių, kuriems vadovauja buvęs disidentas ir politinis kalinys sovietmečiu Balys Gajauskas. Kaip institucija ši komisija turėjo įvairias pakopas: komisiją (tai parlamento nariai, Balys Gajauskas, Algirdas Endriukaitis) ir komisijos darbo grupę. Darbo grupės tikslas buvo vykdyti tyrimus, paremtus KGB bylomis, kurios tapo prieinamomis po SSRS žlugimo. Nors norėta, kad darbo grupė priimtų profesionalius istorikus, grupės darbuotojai buvo parinkti pagal politinį lojalumą komisijos nariams. Darbo grupės vadovas buvo Juozas Starkevičius. Remiantis archyvo radiniais, dalis komisijos narių pradėjo publikuoti KGB medžiagą, kaltindami viešuosius asmenis įsitraukimu į KGB tinklą. Tai turėjo didelį efektą Lietuvos visuomenei. Institucinė komisijos ir darbo grupės transformacija atvedė iki šiandieninio Lietuvos gyventojų genocido ir rezistencijos tyrimų centro, kuris buvo įkurtas 1993 metais liepos 16 d.