Lietuvos centrinis archyvas kaupia ir saugo dokumentus apie valstybės, vietinės valdžios, įmonių ir įstaigų, religinių bendruomenių, visuomeninių ir kitų organizacijų bei privačių asmenų veiklą, kuri datuojama 1918-1990 laikotarpiu. Garso ir vaizdo skyrius saugo audio vizualinius vienetus. Rašytinių dokumentų fondų yra 2177 fondai, kuriuose apie 3,5 milijonai bylų.

Anot archyvisto Vaido Agurkio, archyvas nesiekia įgyti naujų fondų, išskyrus kelias išimtis, kai archyvui kiti saugotojai patys pasiūlo. Atvirkščiai, kai kada LCVA kai kurie fondai yra perduodami kitiems archyvams, kurie labiau atitinka tam tikro fondo profilį. Taip, pavyzdžiui, Lietuvos literatūros or meno archyvui buvo perduotas sovietmečiu cenzūrą vykdžiusio Glavlito fondas. Anot V. Agurkui, LCVA esama tik trijų archyvistų, kurie konkrečiai užsiima naujų fondų aprašymų ir inventorizavimu. Dėl šios priežasties, fondų tvarkymas užtrunka ilgą laikotarpį.